Carbon-X:14.8B DNA 模型 66.7 分,成本仅 1/1800

10 月 22 日,Hugging Face 联合北京中关村学院与意大利那不勒斯费德里科二世大学 Telethon 遗传与医学研究所,发布开源生物模型 Carbon-X,把 DNA 序列与自然语言塞进同一个解码器里。实际参数约 148 亿,基座不是最新的 Qwen3.8,而是 2025 年发布的 Qwen3-14B。研究人员可以直接贴一段基因序列提问:这个突变会不会致病、这段序列调控哪些区域、接下来的碱基该是什么,模型给出的答案附带解释,而不是只丢一个分数。

66.7 分逼近 GPT-6.1 Sol,成本是它的 1/1800

官方模型卡给出的数字是:在 5 项 DNA 理解与生成基准上,Carbon-X 平均得分 66.7%,比起点 Qwen3-14B 高 27 分,落后 GPT-6.1 Sol 的 67.5% 不到 1 分,单题推理成本约为 GPT-6.1 Sol API 的 1/1800。放到真实场景差距更直观:把 ClinVar 中 240 万个意义未明变异全部跑一遍,Carbon-X 约需 300 美元,团队测过的前沿模型则在 3.2 万到 400 万美元区间。

成绩分布并非全面碾压。编码区突变影响判断和序列补全两项上它领先所有参测模型,复杂变异与单碱基变异影响上 GPT-6.1 Sol 和 Claude Opus 5.5 更强。Opus 5.5 在下一碱基预测上只有 1.1%,团队归因于拒答,Gemini 4 Argon 的 FrontierVEP 准确率更随推理强度升高从 58% 掉到 38%。

DNA 专用词表加 3020 亿 Token 继续训练

团队在 Qwen3-14B 文本词表上新增 5515 个 DNA token,其中 4096 个是六碱基一组,另有 1364 个用于长度不足六的尾段,一个 token 正好覆盖六个碱基对,随后用约 3020 亿 token 的 DNA、生物文本、英文与指令数据继续训练。团队自述,高学习率让模型学会 DNA 却忘掉英文,低学习率则英文保住而 DNA 停在随机水平;直接对 Qwen3-14B 做强化学习在 FrontierVEP 上始终不高于随机,必须先完成 DNA 训练。

作为子智能体它还能抬升别的模型:设为必需子智能体后,Kimi K3 在 5 项 DNA 基准上的分数从 49.4% 升到 60.5%。

单张 80GB 显卡能跑,但没做过湿实验

权重以 Apache 2.0 协议开放,bfloat16 下一张 80GB 显卡可装下,官方演示在 MacBook 上通过 llama.cpp 运行,敏感基因数据不必出本机。出于防滥用考虑,训练数据里主动排除了感染真核生物的病毒基因组。限制同样写在模型卡上:尚未在湿实验环境验证,不应作为医疗决策依据,精确序列操作上会数错碱基、混淆坐标,剪接位点与组蛋白标记两类问题得分仅 29.8% 和 34.6%。这与 Hugging Face 想做的事一致,把生物学研究从闭源 API 手里解出来。关于这套模型榜单方法论,可参考 StartLux 霸榜 Hugging Face 的 RLCD² 拆解;中文模型侧的对照可看 Qwen3.8-Omni-Flash 的基准与成本变化。